Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2al1nQ497L1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2al1nQ497L1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2al1nQ497L1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2al1nQ497L1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
H2al1nQ497L1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2al1nQ497L1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms