Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zmat1Q3V0C1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zmat1Q3V0C1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.1 ms