Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbm44Q3V089 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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