Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnpc3Q3UZ01 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms