Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl4Q3URY0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms