Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms