Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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D13Ertd608eQ3UPR8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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