Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms