Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms