Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrch2Q3UMG5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms