Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms