Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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