Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms