Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf5Q3UK78 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms