Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms