Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nom1Q3UFM5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nom1Q3UFM5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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