Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms