Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pid1Q3UBG2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms