Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brf2Q3UAW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms