Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms