Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms