Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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