Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms