Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm4dQ3U2K5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Kdm4dQ3U2K5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Kdm4dQ3U2K5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdm4dQ3U2K5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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