Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fam193bQ3U2K0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam193bQ3U2K0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms