Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pag1Q3U1F9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms