Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hace1Q3U0D9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms