Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
InipQ3TXT3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
InipQ3TXT3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms