Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc28Q3TX51 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc28Q3TX51 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms