Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TchpQ3TVW5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms