Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q3TTJ4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms