Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctdnep1Q3TP92 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdnep1Q3TP92 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms