Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrx1Q3TL44 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrx1Q3TL44 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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