Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrp4cQ3TKR3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms