Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc13Q3TIR1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms