Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms