Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc2Q3SXD3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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