Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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