Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms