Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms