Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm1123Q1RME4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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