Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim71Q1PSW8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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