Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Myo3bQ1EG27 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Myo3bQ1EG27 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms