Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ptchd1Q14B62 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms