Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd2Q149F1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd2Q149F1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms