Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VgfQ0VGU4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VgfQ0VGU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms