Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtel1Q0VGM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms