Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc39dQ0VF76 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttc39dQ0VF76 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms