Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rundc1Q0VDN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms