Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5bQ0V8T8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms